Dall'inizio degli anni '60, Keyhoe, Davidson, e altri ufologi continuarono il loro assalto all'Agenzia per la pubblicazione delle informazioni sugli OVNI. Davidson dichiarava ora che la CIA "era l'unica responsabile della creazione del furore per i dischi volanti come strumenti della guerra fredda psicologica dal 1951." A dispetto degli appelli per una audizione del Congresso e la pubblicazione dei documenti relativi agli OVNI, poco era cambiato. (67)
Nel 1964, seguendo le discussioni di alto livello alla Casa Bianca su cosa fare se una intelligence estero fosse stato scoperto nello spazio e una nuova manifestazione dei rapporti e degli avvistamenti di OVNI, il DCI John McCone domandò un aggiornamento delle valutazioni degli OVNI dalla CIA. Rispondendo alla domanda di McCone, l'OSI domandò al CD di avere degli estratti di molti rapporti d'avvistamenti OVNI recenti del NICAP. Con Keyhoe come cofondatore, più attivo nell'organizzazione, gli ufficiali della CIA rividero Richard H. Hall, direttore supplente. Hall diede agli agenti degli estratti dei dati del NICAP sugli avvistamenti più recenti. (68)
Dopo che gli ufficiali dell'OSI esaminarono la materia, Donald F. Chambellan, Direttore Ausiliario dell'OSI, assicurò McCone che poche cose erano mutate dagli anni '50. Non c'erano prove che gli OVNI fossero una minaccia per la sicurezza degli USA o che fossero "di origine esterna". Chambellan disse a McCone che l'OSI controllava ancora i rapporti di OVNI, compresa l'inchiesta ufficiale dell'Air Force, Projet BLUE BOOK. (69)
Allo stesso momento in cui la CIA conduceva l'ultimo esame interno sugli OVNI, la pressione pubblica forzò l'Air Force a stabilire un comitato ad hoc per esaminare il BLUE BOOK. Presieduta dal Dr Brian O'Brien, un membro del Comitato Consultivo Scientifico dell'Air Force, il panel includeva Carl Sagan, il celebre astronomo della Cornell University. Il Suo rapporto non offrì nessuna novità…. Dichiarò che gli OVNI non erano una minaccia per la sicurezza nazionale e che aveva potuto trovare "alcun caso di OVNIs che rappresentava una avanzata tecnologia o scienza al di fuori di una struttura terrestre."
Il comitato raccomandò che gli OVNI fossero studiati intensamente, con un supplente principale dell'università come coordinatore per il progetto, per risolvere la questione definitivamente.(70)
Il Comitato della Camera sui Servizi Armati, ugualmente procedette allo studio di brevi Dispacci sugli OVNI nel 1966 e ciò produsse dei risultati simili. Il Segretario dell'Aviazione Harold Brown assicurò il comitato che la maggior parte di queste osservazioni erano state spiegate facilmente e che non c'erano prove che gli "Alieni dello spazio" avessero visitato la Terra. C'erano dieci membri del comitato, con l'Air Force che conservava un spirito aperto e che continuava a indagare sui rapporti di OVNI.(71)
Secondo il rapporto del Comitato O'Brien, le audizioni della Casa sugli OVNI, e la rivelazione del rapporto del Dr Robertson in una trasmissione della CBS che la CIA era stata in effetti implicata nell'analisi degli OVNI, l'Air Force prese ancora una nuova volta contatto nel luglio 1966 con l'Agenzia per la declassificazione dell'intero rapporto del Robertson Panel del 1953 e l'intero rapporto Durant sulle delibere e le conclusioni del Robertson Panel. L'Agenzia ancora rifiutò di muoversi.
Karl H. Weber, Direttore Aggiunto dell'OSI, scrisse all'Air Force "che noi siamo assai preoccupato che una pubblicità futura sia data alle informazioni secondo cui il panel è stato sponsorizzato dalla CIA." Weber notò che c'era già una versione asettica disponibile per il pubblico. (72) La risposta di Weber era piuttosto a corto termine e maldiretta. Egli attirò solamente l'attenzione sul rapporto del Robertson Panel vecchio di 13 anni e il ruolo della CIA nelle indagini sugli OVNI. L'editorialista scientifico del The Saturday Review attirò l'attenzione dell'insieme dal paese concernenti il ruolo della CIA nell'investigazioni sugli OVNI quando pubblicò un articolo critico sulla "versione asettica" del rapporto del Robertson Panel del 1953 e lanciò un appello per la pubblicazione del documento completo.(73)
Ignoto agli ufficiali della CIA, il Dr James McDonald, un distinto fisico dell'atmosfera dell'Università dell'Arizona, aveva già visto il Rapporto Durant sui dibattiti del Robertson Panel a Wright-Patterson il 6 giugno 1966. Quando McDonald ritornò a Wright-Patterson il 30 giugno per copiare il rapporto, l'Air Force rifiutò di permettergli di rivederlo, affermando che era un documento classificato dalla CIA. Emergendo come una autorità sugli OVNI, McDonald dichiarò pubblicamente che la CIA era dietro la politica del segreto dell'Air Force e il cover up. Chiese la pubblicazione dell'intero rapporto del Robertson Panel e del rapporto Durant.(74)
Sottomessa alla pressione pubblica e alla raccomandazione del Comitato O'Brien, l'Air Force annunciò nell'agosto 1966 un contratto con una università per intraprendere un programma d'indagini intensive sugli avvistamenti OVNI.

Il nuovo programma è stato concepito per smussare gli attacchi continui secondo cui il Governo USA aveva dissimulato ciò che sapeva sugli OVNI. Il 7 ottobre l'Università del Colorado accettò un contratto di $ 325.000 con l'Air Force per uno studio di 18 mesi sui dischi volanti. Il Dr Edward U. Condon, un fisico del Colorado e ex Direttore del National Bureau of Standards, doveva condurre il programma. Descritto come un "agnostico" sul problema degli OVNI, Condon osservò che aveva un animo aperto sulla questione e pensava che le origini possibili extraterritoriali erano "improbabili ma non impossibili." (75) Il Generale di Brigata Edward Giller, USAF, e il Dr Thomas Ratchford dell'Ufficio di Ricerca e di Sviluppo dell'Air Force divennero i coordinatori dell'Air Force per il progetto.
Nel febbraio 1967 Giller contattò Arthur C. Lundahl, Direttore del Centro Nazionale d'Interpretazione Fotografica della CIA (NPIC), e propose une collegamento ufficiale tra il NPIC e il Comitato Condon per fornire dei consigli tecnici e dei servizi nell'esame delle foto di OVNI presunti. Lundahlet il DDI R. Jack Smith approvarono l'accordo come un metodo per "preservarsi una ritirata possibile" sul nuovo programma.
Hanno voluto che la CIA e il NPIC mantenesse un profilo basso, e non prendessero parte nella scrittura delle conclusioni per il comitato. Nessun lavoro fatto per il comitato dal NPIC fu riconosciuto ufficialmente. (76)
Ratchford domandò, in seguito che Condon e il suo comitato fossero autorizzati a visitare il NPIC per discutere degli aspetti tecnici del problema e osservare il materiale speciale che il NPIC aveva per le analisi foto. Il 20 febbraio 1967, Condon e quattro membri del suo comitato visitarono il NPIC. Lundahl affermò al gruppo che il lavoro del NPIC per aiutare il comitato non doveva essere identificato come un lavoro della CIA. D'altra parte, il lavoro svolto dal NPIC sarebbe stato di natura strettamente tecnico. Dopo la ricezione di queste direttive, il gruppo ebbe una serie di istruzioni sui servizi e il materiale disponibile che non erano stati usati dalla CIA nella sua analisi delle foto di OVNI fornite da Ratchford. Condon e il suo comitato ne furono impressionati.(77)
Condon e lo stesso gruppo si riunirono ancora nel maggio 1967 con il NPIC per una analisi delle foto di OVNI prese a Zanesville, Ohio. L'analisi smonto l'avvistamento. Il comitato fu ancora impressionato dal lavoro tecnico effettuato, e Condon notò che per la prima volta una analisi scientifica di un OVNI confortava l'indagine. (78) Il gruppo discusse il progetto del comitato di lanciare un appello ai cittadini statunitensi per delle foto addizionali e di pubblicare delle direttive per prendere delle foto di OVNI utili. Inoltre, gli ufficiali della CIA consentirono che il Comitato Condon potesse pubblicare il rapporto Durant nella sua interezza con solo delle censure secondarie.
Nell'aprile 1969 Condon e il suo comitato pubblicarono il loro rapporto sugli OVNI. Il rapporto concluse che poco, se non nulla, era stato ricavato dallo studio degli OVNI negli ultimi 21 anni e che uno studio futuro più intenso delle osservazioni di OVNI non era utile. Raccomandò anche che l'unità speciale dell'Air Force, Projet BLUE BOOK, fosse sciolta. Non menzionò la partecipazione della CIA nell'indagine del comitato Condon. (79) Un panel speciale venne stabilito dall'Accademia Nazionale delle Scienze per esaminare il Rapporto Condon e a far coincidere la sua conclusione che "nessuna alta priorità nelle indagini sugli OVNI era utile sulla base dei dati dei due ultimi decenni." Concluse la sua revisione dichiarando, "Sulla base delle conoscenze attuali, la spiegazione meno plausibili per gli OVNI è l'ipotesi di visite extra-terrestri da parte di esseri intelligenti." Seguendo le raccomandazioni del Comitato Condon e dell'Accademia Nazionale delle Scienze, il Segretario dell'Air Force, Robert C. Seamans, Jr., annunciò il 17 la fine del BLUE BOOK nel dicembre 1969. (80)